Annie Di Donna nasceu em Philippeville, na Argélia, sendo filha de pais franceses.
Estudou artes gráficas na École Superieure des Arts Decoratifs de Grenoble e pintura na École des Beaux Arts em Annecy.
De 1987 até 1991, como animadora em muitas produções da France Animation e Canal Plus, entre elas Babar e Tintin.
Em 2004 e até ao verão de 2008, trabalhou a tempo inteiro na obra Logicomix.