Apostolos Doxiadis é natural da Austrália e filho de pais gregos, tendo passado a sua infância e juventude em Atenas.

Estudou na Columbia University, em New York, aonde obteve um bacharelato em Matemática no ano de 1972.

Em Paris, ingressou na École Pratique des Hautes Études para tirar um mestrado, com uma tese sobre modelos matemáticos do sistema nervoso.

Regressou à Grécia, na sequência da morte do seu pai, em 1975.

Esteve envolvido na industria de engenharia de computadores antes de se tornar escritor a tempo inteiro.